幹細胞轉化研究中心基因醫學發展 HPE超級運算加速科研商品化

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基因研究有助了解人體機制和疾病的成因,研究結果有助研發治療方法,造福人群,此時便需要超級電腦運算協助研究。幹細胞轉化研究中心早前透過系統整合商ITENET,度身訂製一套HPE Apollo高效能運算平台,讓多位科研人員同時進行單細胞分析,推進基因醫學的發展,意義非凡。

先進幹細胞研究推動香港領先全球

幹細胞轉化研究中心由多位頂尖科學家及醫生組成,他們攜手合作,將幹細胞技術提升至另一高峰,並將研究成果應用於再生醫學、器官移植及基因藥物等範疇,造福全球人類。幹細胞轉化研究中心助理總監李育華指出,基因研究需要編排DNA序列,要從大量數據、圖像、不同統計模型等作出精密對比及分析,過程需要強大的電腦運算。除此之外,中心內多位科學家同一時間進行各種不同分析,均需應用高速電腦運算,因此中心對運算資源的需求極大。

幹細胞轉化研究中心高級IT技術員陳重匡 (左) 與助理總監李育華 (右) 表示,基因研究需要編排DNA序列,要從大量數據、圖片、不同統計模型等作出精細對比及分析,這對電腦運算需求極大。

過去中心倚靠小型伺服器進行基因研究運算,一來不能應付多人同步分析,二來系統時常不穩定,往往運行了一整天的科研數據,因當機而需重新運算,費時失事。因此中心於2021年第四季決定搜尋新系統,並找來多家負責高效能運算的系統整合商及供應商洽談。

幹細胞轉化研究中心對高效能運算 (HPC) 方案的四大要求:

  • (一) 運算速度快 – 時間就是金錢,必須應用人工智能加速運算;
  • (二) 穩定性強 – 由於執行科研數據運算時間的過程較長,期間系統不能中斷;
  • (三) 高速圖像處理 – 基因研究涉及大量圖像分析及對比,對GPU要求極高;及
  • (四) 高安全性 – 基因研究涉及個人數據私隱,要考慮數據安全及備份方案。

幹細胞轉化研究中心高級IT技術員陳重匡表示:「高效能運算方案在香港較少見,不是每一家系統整合商也能滿足我們的需求。經過與ITENET數次洽談後,ITENET按我們要求,針對性地推薦了各個方案供中心管理層參考,並以中立角度解釋各自效果及優劣,非常中肯可信。」最終中心採納了ITENET與HPE設計的方案,以HPE Apollo系統為核心的高效能運算解決方案。

幹細胞轉化研究中心總監劉澎濤教授 (左) 與ITENET銷售總監Desmond Lau (右) 攜手合作,度身訂製一套HPE Apollo高效能運算平台,推動香港在幹細胞研究上的領先地位。

HPE Apollo:高速穩定智選之選

ITENET銷售總監Desmond Lau表示,HPE Apollo 6500是提供高效能運算與深度學習的理想選擇,配備業界領先的GPU、快速GPU互連、高頻寬網狀架構以及可配置的GPU拓撲,帶來無與倫比的效能。透過HPE Apollo系統可讓科學家們利用大數據進行自主學習、預測和創新優勢。HPE Apollo 6500系統還具有堅實的可靠性、可用性和可維護性 (RAS) ,有效保護科研投資。

ITENET銷售總監Desmond Lau指出,幹細胞轉化研究中心對新系統的穩定性要求極高,因此度身訂造了高效能運算方案,透過科技為醫學研究出一分力。

談到該項目的難處,Desmond Lau透露:「客戶為應付大量基因研究項目,急需使用。由於疫情導致全球IT設備供應鏈緊張,我們需要分批組裝,即使整套方案設備未到齊,也提供部份功能讓客戶應急之用。」憑著Desmond擁有的PMP項目管理專業的資格, 還按客戶要求從方案設計、排序程式設計及開發、營運管理,以及維護方面下了不少功夫。例如為了確保系統運穩定可靠,除了挑選高穩定的HPE Apollo系統外,還考慮到周邊配套如不斷電系統、防水及防塵的效能,訂造了內置冷氣、溫度控制,防水防塵及擁有後備電源的智能機櫃。

高彈性高擴展性應付突發用量增長

新系統至今運行大半年有多,速度快且十分穩定,沒有過去經常停機要重啟伺服器的煩惱。中心助理總監李育華表示:「我們不再需要“人等機“了,HPE Apollo系統可以讓全部研究員同一時間使用,回響體驗流暢爽快。新系統也預留足夠空間,滿足未來擴展需求,至少足夠應付未來五年的使用量,還可以彈性擴充,應付突發性的數據增長需求。作為科研機構,新系統有助我們加速科研商品化,拓建未來營商模式,亦符合可持續發展的環保準則。」

滿足高端要求HPE領跑高效能運算市場

幹細胞轉化研究中心是高效能運算市場上的典型例子,在追求效能的同時,也要求高穩定性及可持續性。HPE香港及澳門副董事總經理郭榮忠表示:「高端客戶自然有極嚴格的要求,能完美滿足各類客戶嚴格要求,這正是我們優勝之處。HPE在高效能運算市場上有領先優勢,無論是醫療科技、金融科技或本地大專院校的科研工作室,HPE也作出巨大貢獻。」除了HPE Apollo系統外,HPE還有大量先進及高效能系統選擇,未來會加強與本地系統整合商合作,提供度身訂造的最佳解決方案,令客戶稱心滿意。

幹細胞轉化研究中心內的HPE Apollo系統為核心的高效能運算設備,可讓中心內全部研究員同一時間使用,加速科研商品化,亦符合可持續發展的環保準則。

網址:itenet.hk
電話:(+852) 3628 3298
電郵:[email protected]


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benny

Benny Yeung ~ 企業IT傳媒人,經常四周穿梭科技巨企及論壇,熱愛探討新商機。性格貪玩,但喜歡閱讀沉悶的企業賺蝕數字,最重視辦事效率。